En el presente estudio se evaluó el efecto de la asociación de dos cepas del hongo Trichoderma atroviride (Endo 1 y Endo 2) y enmiendas orgánicas a base de cacao (Theobroma cacao L.) sobre la población de fitonematodos en tres líneas de banano: Bonifacio (B), Gran Enano (GE) y Williams (W) en la finca comercial de banano de la Universidad EARTH. Se utilizó un experimento con un diseño en bloques completamente al azar (DBCA) subdividido en 27 parcelas de 40 plantas cada una. Nueve parcelas fueron establecidas como testigo y a las 18 parcelas restantes se aplicaron los hongos a una concentración de 4x104 UFC/mL y 1,5 kg de enmiendas orgánicas. Se seleccionaron 12 plantas para tres muestreos de raíces en un intervalo de 60 días. Además, se realizaron tres mediciones de crecimiento sobre cinco plantas de las 12 plantas seleccionadas anteriormente cada 90 días. Las muestras de raíces colectadas fueron sometidas a análisis de peso de raíces funcionales (PRF), peso de raíces muertas (PRM), Índice de Salud Radical (ISR), Índice de Necrosis (IN), y conteo e identificación de fitonematodos: Radopholus similis, Meloidogyne incognita y Helicotylenchus multicinctus. Los resultados de fitonematodos no detectaron diferencias significativas entre los tratamientos (p>0,05). Sin embargo, los tratamientos con hongos presentaron mayor reducción de la población de fitonematodos que el testigo. Los parámetros de PRF, PRM, ISR, e IN no mostraron diferencias significativas entre tratamientos. Sin embargo, el PRF se incrementó con el tiempo lo cual indica que hubo una mejoría en el sistema radical. Asimismo, se ha observado reducciones en el IN e ISR, siendo para el ISR significativa a lo largo del tiempo lo cual indica una mejoría sustancial de la sanidad del sistema radical a través del tiempo. Estos resultados indican que la asociación de hongos Endo 1 y Endo 2 con enmiendas orgánicas a base de cacao tuvieron efecto sobre la población de los fitonematodos bajo las condiciones de este estudio. Las tendencias en la dinámica poblacional de fitonematodos detectadas permiten deducir que existe la posibilidad de obtener resultados promisorios ya que las poblaciones se redujeron con el tiempo, aunque no se detectaron diferencias significativas entre los tratamientos. Mas investigaciones son necesarias para determinar el efecto independiente de las enmiendas orgánicas y de los hongos endofíticos, para dilucidar si existe un efecto aditivo, sinergistico o contraproducente entre las enmiendas y los hongos.