Los hongos formadores de micorrizas arbusculares (HMA) generan para la planta un aporte de nutrientes minerales, especialmente los que son poco móviles en el suelo como es el caso del P. Los nutrientes son extraídos por el micelio externo del hongo de micro sitios impenetrables por los pelos radicales. El presente trabajo estudió la inoculación cruzada de diferentes clones de Theobroma cacao con raíces de cacao micorrizadas, para determinar si existía especificidad entre los HMA y estos clones; además de cuantificar su efecto en el crecimiento de T. cacao en condiciones de vivero. El experimento se estableció en un diseño experimental completamente al azar en un arreglo factorial 3 x 4 (hospedero x inóculo) con 12 tratamientos y 4 repeticiones. La estructura del arreglo factorial consistió en la inoculación cruzada con raíces colonizadas por HMA entre tres clones de T. cacao (CC-246, IMC-67, EET-184). La inoculación de la plantas de T. cacao con HMA fue exitosa; todas las plantas inoculadas mostraron colonización por los HMA, que en promedio fue del 42.0 %. La dependencia relativa de las plantas de T. cacao de los HMA varió según el clon con el que se inoculó cada planta, pero se obtuvo un rango de entre 4.85 % y 46.0 %. Las plantas inoculadas con los HMA tuvieron un mayor diámetro, una mayor producción de biomasa aérea, biomasa de raíces y de biomasa total. Todos los clones inoculados con HMA fijaron más C que el tratamiento testigo; además, absorbieron mayor cantidad de N, P, K, Mg, Cu, Zn. No se encontró especificidad de los clones por un inóculo en particular, lo importante en este caso es la inoculación en sí. La mayor fijación de C y absorción de nutrientes por los clones inoculados con HMA se vio reflejada en mayor producción de biomasa aérea, biomasa de raíces y de biomasa total, con lo que se demuestra que la práctica de inocular plantas de T. cacao en el vivero es una práctica que producirá mejores plantas para ser llevadas a campo.